Una de las formas de colaboración innovadoras y que relacionan a la Universidad con la sociedad son las cátedras Universidad-Entidad, en las que la Universidad y una o varias empresas o instituciones se comprometen a colaborar en el desarrollo de actividades docentes e investigadoras en un campo determinado, durante un periodo de tiempo que permita la consolidación de equipos humanos y la obtención de un avance significativo en el campo de la cátedra.
La Fundación Teófilo Hernando y su Instituto Teófilo Hernando para la I+D del Medicamento han propuesto, coordinado o dirigido diversas cátedras de patrocinio entre la Universidad Autónoma de Madrid y diferentes entidades relacionadas con la I+D de medicamentos. En la actualidad, estas son las cátedras de patrocinio en las que participa la Fundación Teófilo Hernando (FTH):
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